全國共有62所中藥學專業的大學參與了2016中藥學專業大學排名，其中排名第一的是上海中醫藥大學，排名第二的'是北京中醫藥大學，排名第三的是成都中醫藥大學，以下是中藥學專業大學排名2016具體榜單（來源：中國校友會），供大家參考：
| 全國排名 | 學校名稱 | 學科星級 | 學科類型 | 辦學層次 |
| 1 | 上海中醫藥大學 | 8星級 | 研究型 | 世界一流學科 |
| 2 | 北京中醫藥大學 | 7星級 | 研究型 | 世界知名高水平學科 |
| 2 | 成都中醫藥大學 | 7星級 | 研究型 | 世界知名高水平學科 |
| 4 | 黑龍江中醫藥大學 | 6星級 | 研究型 | 世界高水平學科 |
| 4 | 南京中醫藥大學 | 6星級 | 研究型 | 世界高水平學科 |
| 6 | 中國藥科大學 | 6星級 | 研究型 | 中國頂尖學科 |
| 7 | 天津中醫藥大學 | 5星級 | 研究型 | 世界知名學科 |
| 8 | 廣州中醫藥大學 | 5星級 | 研究型 | 中國一流學科 |
| 9 | 安徽中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 長春中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 福建中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 廣西中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 甘肅中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 第二軍醫大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 北京協和醫學院 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 中國科學院大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 浙江中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 雲南中醫學院 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 新疆醫科大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 武漢大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 瀋陽藥科大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 陝西中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 山東中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 南方醫科大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 遼寧中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 江西中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 吉林農業大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 湖南中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 暨南大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 西北大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 湖北中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 河南中醫藥大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 河北中醫學院 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 哈爾濱商業大學 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 9 | 貴陽中醫學院 | 4星級 | 研究型 | 中國高水平學科 |
| 36 | 安徽醫科大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 承德醫學院 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 廣東藥科大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 中南民族大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 西南交通大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 西南大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 西北農林科技大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 溫州醫科大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 上海交通大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 陝西師範大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 陝西科技大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 山西中醫學院 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 寧夏醫科大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 浙江工業大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 右江民族醫學院 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 揚州大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 西南醫科大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 內蒙古醫科大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 內蒙古民族大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 南京農業大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 江蘇大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 吉林農業科技學院 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 華東理工大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 河南大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 北京師範大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 36 | 青海大學 | 3星級 | 研究型 | 中國知名學科 |
| 62 | 北京城市學院 | 3星級 | 應用技術型 | 區域一流學科 |
