1、負責轄區內出入境人員、交通工具的衛生檢疫查驗管理工作。
2、負責收集與傳遞國內外傳染病疫情信息，制定突發傳染病防治工作預案。
3、負責出人境交通工具和口岸衛生監督管理工作，會同有關部門對國境口岸儲存場地進行衛生許可證的考覈發放工作。
4、負責組織調査、收集境內外病媒媒介生物種類、種羣的'分佈資料，並組織實施衛生監督和防治措施工作。
5、負責微生物、人體組織、器官、血液及其製品、生物製品等特殊物品的人境處理工作。
6、負責進出口食品檢驗檢疫工作；負責出口生產、加工企業的監督管理與檢査；協同有關
部門對企業衛生註冊登記工作進行管理；協助有關部門開展打假工作。
7、承辦重大衛生檢疫、食品衛生和質量監督檢驗問題及發生食源性疾病的調查和處理工作。
8、負責衛生檢疫、食品衛生和質量監督檢驗有關方法標準與技術法規的推廣工作。
9、負責會同有關部門監督檢查主管商品的質量狀況和檢驗檢疫工作情況，並對重大問題進行調査處理。
10、負責衛生檢疫、衛生監督與傳染病監測的信息統計工作；負責進出口食品和質量評價及監督檢驗的信息(統計與質量分析)工作。
11、承辦上級和局領導交辦的其他事項。
