很多常見攻擊，例如跨站點腳本攻擊(XSS)、SQL注入、 跨站點僞造請求(CSRF)，以及XML外部實體(XXE)絲毫沒有涵蓋。你可以阻止web應用程序和web服務暴露於這些攻擊，但這需要一定量的工作和 測試。幸運的是，Open Web Application Security Project(OWASP)公佈了“10大最關鍵的web應用程序安全風險”的報告。
1.注入
注入發生在開發人員獲取不可信的信息，例如arameter()，ookie()，或 eader()，並在命令接口中使用它的任何時候。例如，SQL注入在你連接不可信的數據到常規SQL查詢，如“SELECT * FROM users WHERE username=‘“ + arameter(“user”) + “‘ AND password=‘“ + arameter(“pass”) = “‘“時發生。開發人員應該使用PreparedStatement來防止攻擊者改變查詢的含義和接管數據庫主機。還有許多其他類型的注入，如 Command注入、LDAP注入以及Expression Language (EL) 注入，所有這些都極度危險，因此在發送數據到這些解釋器的時候要格外小心。
2.損壞的驗證和會話管理
JavaEE支持身份驗證和會話管理，但這裏有很多容易出錯的地方。你必須確保所有經過驗證流量都通過SSL，沒有例外。如果你曾經暴露 JSESSIONID，那麼它就可被用來在你不知情的情況下劫持用戶會話。你應該旋轉JSESSIONID，在用戶進行身份驗證以防止會話固定攻擊 (Session Fixation attack)的時候。你應該避免使用deURL()，因爲它會添加用戶的JSESSIONID到URL，使得更容易被披露或 被盜。
3.跨站點腳本攻擊(XSS)
XSS發生在當JavaEE開發人員從HTTP請求獲取不可信的信息，並把它放到HTTP響應中，而沒有適當的上下文輸出編碼的時候。攻擊者可以利 用這個行爲將他們的腳本注入網站，然後在這個網站上劫持會話和竊取數據。爲了防止這些攻擊，開發人員需要執行敏感的上下文輸出編碼。如果你把數據轉換成 HTML，使用&#xx;格式。請務必括號HTML屬性，因爲有很多不同字符而不帶括號的屬性會被終止。如果你把不可信的數據放到 JavaScript，URL或CSS中，那麼對於每一個你都應該使用相應的轉義方法。並且在和嵌套上下文，如一個用Javascript寫的在HTML 屬性中的URL打交道時，要非常小心。你可能會想要編碼庫，例如OWASP ESAPI的幫助。
4.不安全的直接對象引用
任何時候應用程序暴露了一個內部標識符，例如數據庫密鑰，文件名，或hashmap索引，攻擊者就可以嘗試操縱這些標識符來訪問未經授權的數據。例 如，如果你將來自於HTTP請求的不可信的數據傳遞到Java文件構造器，攻擊者就可以利用“../”或空字節攻擊來欺騙你的驗證。你應該考慮對你的數據 使用間接引用，以防止這種類型的攻擊。ESAPI庫支持促進這種間接引用的ReferenceMaps。
5.錯誤的安全配置
現代的JavaEE應用程序和框架，例如Struts和Spring中有着大量的安全設置。確定你已經瀏覽過這些安全設置，並按你想要的那樣設置。 例如，小心
6.敏感數據暴露
Java有大量的加密庫，但它們不容易正確使用。你應該找到一個建立在JCE基礎上的庫，並且它能夠方便、安全地提供有用的加密方法。比如 Jasypt和ESAPI就是這樣的庫。你應該使用強大的算法，如AES用於加密，以及SHA256用於hashes。但是要小心密碼hashes，因爲 它們可以利用Rainbow Table被解密，所以要使用自適應算法，如bcrypt或PBKDF2。
7.缺少功能級訪問控制
JavaEE支持聲明式和程序式的訪問控制，但很多應用程序仍然會選擇創造它們自己的方案。像Spring框架也有基於註釋的訪問控制基元。最重要 的事情是要確保每一個暴露的端口都要有適當的訪問控制檢查，包括web服務。不要以爲客戶端可以控制任何東西，因爲攻擊者會直接訪問你的端點。
8.跨站點僞造請求(CSRF)
每個改變狀態的端點需要驗證請求有沒有被僞造。開發人員應該在每個用戶的會話中放入隨機令牌，然後當請求到達的時候驗證它。否則，攻擊者就可以通過 鏈接到未受保護的應用程序的惡意IMG，SCRIPT, FRAME或FORM標籤等創建“攻擊”頁面。當受害者瀏覽這種頁面時，瀏覽器會生成一個“僞造”的HTTP請求到URL在標籤中被指定的任何內容，並且 自動包括受害人的認證信息。
9.使用帶有已知漏洞的`組件
現代的JavaEE應用程序有數百個庫。依賴性解析工具，如Maven，導致了這個數字在過去五年時間裏出現爆炸式增長。許多廣泛使用的Java庫 都有一些已知的漏洞，會讓web應用程序被完全顛覆。解決的辦法是及時更新庫。不要只運行單一掃描，因爲新的漏洞每天都在發佈。
10.未經驗證的轉址和轉送
任何時候你的應用程序使用不可信的數據，例如arameter()或ookie()，在調用 Redirect()時，攻擊者可以強制受害者的瀏覽器轉到一個不受信任的網站，目的在於安裝惡意軟件。forward也存在 着類似的問題，不同之處在於攻擊者可以轉送他們自己到未經授權的功能，如管理頁面。一定要仔細驗證轉址和轉送目標。
你應該持續留意這些問題。新的攻擊和漏洞總是在被發現。理想情況下，你可以集成安全檢查到現有的構建、測試和部署過程。
要在應用程序中檢查這些問題，可以嘗試免費的Contrast for Eclipse插件 。這不是一個簡單的靜態分析工具。相反，C4E利用Java儀表化API，來監視應用程序中與安全相關的一切。 C4E甚至能實時地做到完整的數據流分析，因此它可以跟蹤來自於請求的數據，通過一個複雜的應用程序。例如，假設你的代碼獲取了一個參數值，用 base64解碼它，再存儲於map中，把map放到數據bean中，再將bean存儲到一個會話屬性中，在JSP中獲取bean的值，並使用EL將這個 值插入到網頁。Contrast for Eclipse可以跟蹤這些數據並報告XSS漏洞。哪怕你正在使用的是複雜的框架和庫。沒有其他工具能在速度，精度和易用性方面與之媲美。
