最初入選“985工程”的高等學校共有九所，被稱“九校聯盟”，截至2013年年末，“985工程”共有39所高校。此後，中華人民共和國教育部表示“985工程”和“211工程”的規模已經穩定，將不會再新增高校，而是引入動態競爭機制，遴選已經是“211工程”建設且是中央部屬的.頂尖行業特色型大學實施“985工程優勢學科創新平臺”項目。
985大學排名其實並不容易，各所學校的側重研究方向不一樣，各有所長同時也各有所短。在這裏，根據大致的實力情況簡要進行了分檔，如下：
985大學排名第一檔：
兩牛校：清華大學、北京大學、
七名校：復旦大學、中國人民大學、上海交通大學、浙江大學、中國科學技術大學、南京大學。
985大學排名第二檔：
理工類：同濟大學、哈爾濱工業大學、西安交通大學、北京航空航天大學、天津大學、華中科技大學、東南大學。
綜合類：南開大學、中山大學、武漢大學、廈門大學。
專屬類：北京師範大學、國防科學技術大學
985大學排名第三檔：
綜合類：吉林大學、四川大學、湖南大學、山東大學。
理工類：中南大學、華南理工大學、北京理工大學、大連理工大學、西北工業大學、重慶大學、電子科技大學。
985大學排名第四檔：
綜合類：蘭州大學、東北大學。
專屬類：華東師範大學、中國農業大學、中國海洋大學、西北農林科技大學、中央民族大學。
本名單來源於教育部網站，截止到2011年3月31日，全國共有39所高校。
| “985”工程大學名單 | ||
| 一期（34所） | ||
| 清華大學 | 北京大學 | 廈門大學 |
| 南京大學 | 復旦大學 | 天津大學 |
| 浙江大學 | 南開大學 | 西安交通大學 |
| 東南大學 | 武漢大學 | 上海交通大學 |
| 山東大學 | 湖南大學 | 中國人民大學 |
| 吉林大學 | 重慶大學 | 電子科技大學 |
| 四川大學 | 中山大學 | 華南理工大學 |
| 蘭州大學 | 東北大學 | 西北工業大學 |
| 哈爾濱工業大學 | 華中科技大學 | 中國海洋大學 |
| 北京理工大學 | 大連理工大學 | 北京航空航天大學 |
| 北京師範大學 | 同濟大學 | 中南大學 |
| 中國科學技術大學 | ||
| 二期（5所） | ||
| 中國農業大學 | 國防科學技術大學 | 中央民族大學 |
| 華東師範大學 | 西北農林科技大學 | |
備註 2011年3月7日，教育部部長袁貴仁在列席全國政協十一屆四次會議教育界別聯組會時表示，“985”、“211”已經關上大門，不會再有新的學校加入這個行列。
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