數控系統是數控機牀的核心部件，因此，數控機牀的維護主要是數控系統的維護。數控系統經過一段較長時間的使用，電子元器件性能要老化甚至損壞，有些機械部件更是如此，爲了儘量地延長元器件的壽命和零部件的磨損週期，防止各種故障，特別是惡性事故的發生，就必須對數控系統進行日常的維護。數控機牀的維護方法主要是以下幾方面。
1、制訂數控系統日常維護的規章制度：
根據各種部件特點，確定各自保養條例。如明文規定哪些地方需要天天清理(如CNC系統的輸入/輸出單元——光電閱讀機的清潔，檢查機械結構部分是否潤滑良好等)，哪些部件要定期檢查或更換(如直流伺服電動機電刷和換向器應每月檢查一次)。
2、應儘量少開數控櫃和強電櫃的門：
因爲在機加工車間的空氣中一般都含有油霧、灰塵甚至金屬粉末。一旦它們落在數控系統內的印製線路或電器件上，容易引起元器件間絕緣電阻下降，甚至導致元器件及印製線路的損壞。有的用戶在夏天爲了使數控系統超負荷長期工作，打開數控櫃的門來散熱，這是種絕不可取的方法，最終會導致數控系統的加速損壞。正確的方法是降低數控系統的外部環境溫度。因此，應該有一種嚴格的規定，除非進行必要的調整和維修，不允許隨便開啓櫃門，更不允許在使用時敞開櫃門。
3.定時清掃數控櫃的散熱通風系統：
應每天檢查數控系統櫃上各個冷卻風扇工作是否正常，應視工作環境狀況，每半年或每季度檢查一次風道過濾器是否有堵塞現象。如果過濾網上灰塵積聚過多，需及時清理，否則將會引起數控系統櫃內溫度高(一般不允許超過55℃)，造成過熱報警或數控系統工作不可靠。
4.經常監視數控系統用的電網電壓：
FANUC公司生產的數控系統，允許電網電壓在額定值的85%～110%的範圍內波動。如果超出此範圍，就會造成系統不能正常工作，甚至會引起數控系統內部電子部件損壞。
5.定期更換存儲器用電池：FANUC公司所生產的數控系統內的存儲器有兩種：
(1)不需電池保持的磁泡存儲器。
(2)需要用電池保持的CMOSRAM器件，爲了在數控系統不通電期間能保持存儲的內容，內部設有可充電電池維持電路，在數控系統通電時，由 5V電源經一個二極管向CMOSRAM供電，並對可充電電池進行充電;當數控系統切斷電源時，則改爲由電池供電來維持CMOSRAM內的信息，在一般情況下，即使電池尚未失效，也應每年更換一次電池，以便確保系統能正常工作。另外，一定要注意，電池的.更換應在數控系統供電狀態下進行。
6.數控系統長期不用時的維護：
數控機牀不宜長期封存不用，購買數控機牀以後要充分利用，尤其是投入使用的第一年，使其容易出故障的薄弱環節儘早暴露，得以在保修期內得以排除。爲提高數控系統的利用率和減少數控系統的故障，數控機牀應滿負荷使用，而不要長期閒置不用，由於某種原因，造成數控系統長期閒置不用時，爲了避免數控系統損壞，需注意以下兩點：
(1)要經常給數控系統通電，特別是在環境溼度較大的梅雨季節更應如此，在機牀鎖住不動的情況下在沒有加工任務時，數控機牀也要定期通電，最好是每週通電1-2次，
(2)每次空運行1小時左右，以利用機牀本身的發熱量來降低機內的溼度，使電子元件不致受潮，同時也能及時發現有無電池報警發生，以防止系統軟件、參數的丟失。
