關於交通運輸車輛的通行費徵收營業稅的問題，財政部和國家稅務總局先後下發了幾個文件，根據《營業稅暫行條例》及其實施細則的規定，車輛通行費如何繳納營業稅、按什麼稅目、按什麼稅率繳納營業稅呢？筆者作了以下歸納。
什麼樣的收費需要繳納營業稅
根據國務院發佈的《收費公路管理條例》（國務院令第417號）規定，我國現行的收費公路分爲兩類：一類是縣級以上地方人民政府交通主管部門利用貸款或者向企業、個人有償集資建設的公路，簡稱政府還貸公路；另一類是國內外經濟組織投資建設或者依照公路法的規定受讓政府還貸公路收費權的公路，簡稱經營性公路。根據《營業稅暫行條例》及其實施細則的規定，國家稅務總局下發《國家稅務總局關於廣播電視系統、交通、工商、公安等部門的有關收費項目徵收營業稅的批覆》（國稅函〔1998〕766號）規定，交通部門收取的車輛通行費（即過路費、過橋費）是提供營業稅應稅勞務取得的收入，屬於營業稅的徵稅範圍。按照當時的稅法規定，對於上述兩類收費公路收取的車輛通行費，全部需要繳納營業稅。但是在2000年，財政部、國家稅務總局根據國務院批轉財政部等部門《交通和車輛稅費改革實施方案的通知》（國發〔2000〕34號）的規定，下發了《財政部、國家稅務總局關於車輛通行費有關營業稅等稅收政策的通知》（財稅〔2000〕139號），根據該文件的規定，自2000年10月22日起，凡交通、建設部門貸款或按照國家規定有償集資修建路橋、隧道、渡口、船閘收取的`車輛通行費、船舶過閘費，收費項目由省、自治區、直轄市財政部門會同物價、交通和建設部門審覈，收費標準由省、自治區、直轄市物價部門會同財政、交通或建設部門審覈後，報同級人民政府審批，收費時要按照有關規定到規定的價格主管部門申領收費許可證，使用省、自治區、直轄市財政部門統一印（監）制的收費票據，所收資金全額納入財政專戶，實行“收支兩條線”管理，不繳納營業稅。該文件同時規定，凡國內外經濟組織設立公路或城市道路經營企業收取車輛通行費，統一由省、自治區、直轄市物價部門會同交通或建設部門審覈後，報同級人民政府審批，收費時要按照有關規定使用稅務發票，依法繳納各項稅款。由此可以認爲，目前的稅收政策是對經營性公路的車輛通行費應當繳納營業稅；而對政府還貸公路的車輛通行費，在同時滿足“經省級政府批准”和“收支兩條線管理”兩個條件的情況下，不繳納營業稅。另外，不繳納營業稅的通行費必須是由行政機關自己直接收取的，交通部門將收費權轉讓給其他單位或者委託其他單位收取通行費，由其他收取車輛通行費的單位繳納營業稅。
按什麼稅目繳納營業稅
現行營業稅稅目註釋（國稅發〔1993〕149號）並未對車輛通行費以及過路費、過橋費適用何種稅目作出十分明確規定，很多基層稅務徵收人員在實際操作中，對車輛通行費是按“服務業”稅目，還是“交通運輸業”稅目繳納營業稅也不是十分清楚。但1994年初，國家稅務總局就下發了《國家稅務總局關於中外合資××公路橋樑開發有限公司稅收問題的批覆》（國稅函發〔1994〕32號），在該文件中明確規定，對企業所建商品路收費站所收取的費用應依“服務業”稅目5%的稅率繳納營業稅。綜上所述，車輛通行費應按“服務業———其他服務業”稅目繳納營業稅。
按什麼稅率繳納營業稅
《財政部、國家稅務總局關於公路經營企業車輛通行費收入營業稅政策的通知》（財稅〔2005〕77號）規定，自2005年6月1日起，對公路經營企業收取的高速公路車輛通行費收入統一減按3%的稅率徵收營業稅。這裏需要注意的是財稅〔2005〕77號文件，規定的範圍是公路經營性企業收取的車輛通行費，而不是政府還貸公路收取的車輛通行費，並且僅涉及對高速公路車輛通行費減徵營業稅的問題，而對於不屬於高速公路的經營性公路的車輛通行費收入不屬於減徵營業稅的範圍，仍然按5%的稅率繳納營業稅。
