一、農藥安全使用原則
食用菌生產中對病蟲害進行化學藥劑防治，要嚴格遵循其農藥安全使用原則，以確保產品安全和施藥者的人身安全。
1、知藥選藥
食用菌生產用藥前應先熟悉農藥的性質，應瞭解殺蟲劑和殺菌劑兩大類的區別，分別用於防治蟲害和病害，不能互換。殺蟎劑不能替代殺線蟲劑。要熟悉農藥的理化性質、作用特點、使用方法、濃度與噴灑時間等。
2、要對症下藥
食用菌發生眼蕈蚊、糞蚊，棚室500倍敵百蟲對菇蠅類的成蟲、幼蟲有特效，但對蟎類殺傷力差。平菇對敵敵畏敏感，濃度稍大就可能產生藥害，最好改用敵百蟲或辛硫磷。雙孢菇對敵百蟲敏感，最好改用敵敵畏。如果有蚊蠅類和蟎類同時發生，用辛硫磷和殺蟎劑混配效果較好。
3、使用濃度合理
食用菌生產中要根據藥劑種類、病蟲害、食用菌不同生長階段，確定用藥濃度。一般播種前堆料及菇房物料消毒用藥範圍和濃度相對大一些，播種後及出菇前用藥要嚴格控制在安全範圍之內，子實體階段濃度應更低一些。如辛硫磷加殺蟎劑防治蟎類等害蟲，堆料到出菇前用500倍液，而子實體階段必須用藥時應降至1000倍液。
4、菇期禁用農藥
注重菇前預防，併爲食用菌生長創造優良的環境，增強本身抗病能力。必須用藥時，要選在出菇前，或將菇採淨。因爲食用菌栽培週期短，藥物容易殘留而引起食物中毒，進而會對產品的流通與消費產生嚴重影響。而且這些農藥也會對食用菌產生藥害。
5、選用高效低毒低殘留的藥劑
選用高效低毒低殘留的藥劑，禁用劇毒農藥常用的殺菌劑有多菌靈、百菌清、克黴靈、代森鋅、甲基託布津、波爾多液、石硫合劑和硫磺粉等：常用的殺蟲劑有辛硫磷、敵敵畏、敵百蟲、殺滅菊醋、磷化鋁、殺蟎特等。也可使用微生物製劑。無論是拌料、堆料或是菇房防治，嚴禁選用劇毒的'、殘留期長的有機汞、有機磷等藥劑。不同藥劑交替使用可避免病菌、害蟲產生抗藥性而降低藥效。
6、注意保護人身安全
磷化鋁遇水生成的磷化氫穿透力強，對眼蕈蚊、糞蚊、跳蟲、線蟲等的防治效果很好，且無殘毒，但其本身對人有毒，燻蒸操作時要戴防護面具，操作人員要2人以上確保人身安全。
二、農藥安全使用注意事項
1、在出菇期間，使用農藥要十分慎重，禁止農藥沾染在蘑菇上，否則會造成食品污染。
2、禁止直接將有劇毒的有機汞、有機磷等藥劑用於拌料、堆料；殘效期長，不易分解及有刺激性臭味的農藥，也不能用於菇牀。特別是牀面有菇時，絕對禁止使用毒性強、殘效期長或帶有刺激性臭味的藥劑。
3防治病蟲害時，選用的藥劑，要根據防治對象選擇藥劑種類和使用濃度。如敵敵畏具薰殺和觸殺作用，對菇蠅類的成蟲、幼蟲以及跳蟲有特效，但對蟎類殺傷力差；辛硫磷是一種新型高效、低毒、低殘留的有機磷殺蟲劑，除對菇蠅、跳蟲有特效外，對蟎類亦有良好的觸殺作用，藥效優於敵敵畏；若用辛硫磷加殺蟎劑防治蟎類，則效果優於其他農藥。施藥要選擇合適濃度，辛硫磷加殺蟎劑，從堆肥到出菇期前各用500倍液防蟎，但籽實體發育階段濃度應降到1000倍液。
4、使用農藥時，要先熟悉農藥性質。
5、儘可能使用植物性殺蟲劑和微生態製劑，如除蟲菊、魚藤精、增產菌等製劑。
6、保護天敵，不可濫用農藥。
