專家提醒說，首先肝功能檢查的敏感程度有一定限度，而且肝臟代償儲備能力很強，因此肝功能檢查正常不一定沒有肝病，另外，肝功能檢查中的`有些指標缺乏特異性，所以肝功能異常也不一定就是肝病。此外，血清酶的活性是一項很重要的評判標準，但它不反映肝臟功能，酶的指標只是對肝細胞完整性的估計。
總之，肝功能檢查只能作爲診斷肝膽系統疾病的一種輔助手段；要對疾病作出正確診斷，還必須結合病史、體格檢查及影象學檢查等，全面地綜合分析。
最後，專家提醒做肝功能檢查時應注意，必須在空腹時抽血檢查。對於初次檢查肝功能者，尤應如此。抽血檢查前一天最好禁酒類。肝功能檢查多項內容測定值與飲食有一定關係，如飲酒易使某些血清酶值升高，進食油膩食物後可以使血脂增高等。
