時下，屋頂種菜已成爲潮流，都市農夫的隊伍也日漸興盛。不過從安全的角度出發，屋頂種菜一定要注意以下事項。
一、不能破壞房屋原結構
在種植菜園之前應先了解屋頂的承重荷載，不能盲目栽種。一般能上人的鋼筋混凝土樓頂承重荷載爲150公斤/平方米，鬆散的種植土每立方米重量在1噸-1噸半左右，也就是說，土層厚度達到15釐米左右便達到了屋頂荷載。吸收大量水份的泥土，增加了屋頂承重，影響結構。
二、防止屋頂漏水，做好排水系統
屋頂種菜後，防水是一項不可忽視的.問題。若在屋頂種植蔬菜，需要重新做防水層。一般老舊小區的防水層採用瀝青鋪設，十幾年後便會老化，如果需要種植蔬菜，必須重新加新型防水材料做防水層。而新建小區一般使用新型材料進行防水，但仍然需要再加一層高分子建材，做雙重保護。儘量用塑膠種植盆或陶瓷種植盆或其他容器代替泡沫箱。
由於澆灌菜地時會有大量的水注入，所以要事先做好排水系統，以防地上積水造成屋頂滲水。幾乎任何類型的容器都可用來種菜，只要它足夠堅固，能提供足夠的空間和排水通道。除了傳統的花盆、花槽等專業容器外，許多生活中的器物都可改造利用，如塑料盆、提桶、花箱、木箱、鋁皮箱、食品罐等。但無論選用什麼容器，都要保證底部有排水孔。
三、不能使用化學殺蟲劑
自家屋頂種菜，主要追求健康環保，所以不能使用對身體有害的化學殺蟲劑。如果有蟲害，可以採用生物殺蟲的方法，比如：大蒜汁，辣椒水。
四、不用郊區或路邊的土
城裏的廢土和郊區農田土裏面都有農藥或重金屬殘留，用這樣的土種出來的菜並不安全。
五、靠近馬路有空氣污染
屋頂種菜還要考慮空氣中的污染，如果樓高低於12米並靠馬路邊，就不適宜種菜，因爲正處於汽車尾氣及馬路揚塵的覆蓋範圍。即使在小區內部或高樓頂，菜地裏也最好施點硅肥，可以將重金屬留在種植土內，不讓植物吸收。
