(1)作爲分解者參與物質循環。即把動植物遺體分解成二氧化碳、水和無機鹽，被植物重新吸收利用，製造有機物。故對於自然界中二氧化碳等物質的循環起重要作用
(2)引起動植物和人患病。這類微生物多營寄生生活，從活的動植物體上吸收營養物質。如鏈球菌引起扁桃體炎，真菌引起癬、小麥葉鏽病(注意：腳氣和細、真菌沒關係(是缺維生素B導致的.)
(3)與動植物共生。共生指一種生物與另一種生物共同生活在一起，相互依賴、彼此有利的現象，簡言之，互利共生。(1)如真菌與藻類共生形成地衣(2)根瘤菌與豆科植物，(3)與動物：兔、牛、羊內有些細菌幫助分解纖維素(4)與人：人的腸道中有一些細菌能製造維生素B12和維生素K對身體有益
