(一)覈算的基本原則
(1)住房公積金的核算要實現兩個分賬：一是管理中心管理的住房公積金和其他住房資金要實行分賬覈算。管理中心自身業務的核算，執行《事業單位會計制度》;二是住房公積金增值收益和管理中心管理費用應嚴格實行分立賬戶，單獨覈算。
(2)管理中心要設立住房公積金個人明細賬，實行三級明細覈算：住房公積金總賬覈算(一級科目)、住房公積金單位賬戶覈算(二級科目)、住房公積金個人賬戶覈算(三級科目)保證賬賬相符，賬實相符。
(3)對住房公積金收入和支出的'覈算採用對應的核算原則，即權責發生制或收付實現制。目前，管理中心對住房公積金收支業務一般採用權責發生制原則進行覈算。
(二)覈算的內容
管理中心要在建立住房公積金總賬與職工明細賬的基礎上，建立完整的財務管理制度，對住房公積金管理實行全過程的資產管理。住房公積金管理執行《住房公積金財務管理辦法》。
住房公積金財務管理是管理中心組織財務活動、處理財務關係的一項經濟管理工作。管理中心的財務活動主要包括資金歸集、使用及其產生的收益分配所引起的財務活動。
住房公積金財務管理的基本原則是：執行國家有關法律、法規、規章和財政、財務制度;建立健全內部財務制度，做好財務管理基礎工作;降低運作風險，保證住房公積金保值增值，確保住房公積金所有者的合法權益不受侵犯;厲行節約，制止奢侈浪費。
住房公積金財務管理的主要任務：編制住房公積金和管理中心管理費用年度預決算;建立職工住房公積金明細賬，記載職工個人住房公積金的繳存、提取等情況;依法辦理住房公積金委託貸款業務，防範風險;嚴格執行住房公積金管理委員會批准的住房公積金歸集、使用計劃;覈算住房公積金及其增值收益;嚴格執行財政部門批准的管理a費用預算，控制管理費用支出，努力降低住房公積金運作成本。
