抗原在化學結構上與機體自身不同。異物性的物質有3種：①異種物質：從生物進化過程來看，異種動物間的血緣關係愈遠，則免疫原性愈強。如馬的血清和各種微生物與人的血緣關係遠，所以免疫原性強。而馬的血清與驢、騾的血緣關係近，所以免疫原性相對的弱;②同種異體物質：即同種不同個體共有的物質，如人的紅細胞抗原物質和人的白細胞抗原等;③自身物質：自身物質一般不具免疫原性。有些物質如隱蔽的自身成分(眼晶體蛋白、精子等)，在正常情況下與免疫系統是隔絕的。但是一旦屏障遭到破壞，這些物質進入血流，即可與免疫活性細胞接觸而成爲自身抗原異物。另外，自身物質在外傷、感染、藥物和射線的影響下，其理化性質發生質的改變時，也可成爲具有免疫原性的抗原物質。
基本特性：
異物性
抗原在化學結構上與機體自身不同。異物性的物質有3種：①異種物質：從生物進化過程來看，異種動物間的血緣關係愈遠，則免疫原性愈強。如馬的血清和各種微生物與人的血緣關係遠，所以免疫原性強。而馬的血清與驢、騾的血緣關係近，所以免疫原性相對的弱;②同種異體物質：即同種不同個體共有的物質，如人的紅細胞抗原物質和人的白細胞抗原等;③自身物質：自身物質一般不具免疫原性。有些物質如隱蔽的.自身成分(眼晶體蛋白、精子等)，在正常情況下與免疫系統是隔絕的。但是一旦屏障遭到破壞，這些物質進入血流，即可與免疫活性細胞接觸而成爲自身抗原異物。另外，自身物質在外傷、感染、藥物和射線的影響下，其理化性質發生質的改變時，也可成爲具有免疫原性的抗原物質。
一定的理化性質
顆粒性物質易被吞噬加工，是良好的抗原。分子量大於 10 000的蛋白質也是良好的抗原。芳香族氨基酸在確定免疫原性中起重要的作用。但是，有些分子量較小(5 000～10 000)的物質也可以成爲弱抗原，如結合球蛋白、胰島素等。
特異性
反映在兩個方面：①能刺激機體產生具有高度針對性的免疫應答(免疫原性的特異性);②只能與其相對應的抗體或致敏淋巴細胞結合而不能與無關的抗體或致敏淋巴細胞結合(反應原性的特異性)。抗原的特異性由暴露在抗原分子表面的抗原決定簇的性質所決定。一個抗原性物質可有多種和多個抗原決定簇。抗原分子量愈大，決定簇的數目愈多。最易引起免疫應答的抗原決定簇稱爲免疫顯性決定簇。
