本病主要因脾寒、心熱、驚恐所致。
脾寒腹痛是導致夜啼的常見原因。常由孕母素體虛寒、恣食生冷，胎稟不足，脾寒內生。或因護理不當，腹部中寒，或用冷乳哺食，中陽不振，以致寒邪內侵，凝滯氣機，不通則痛，因痛而啼。由於夜間屬陰，脾爲至陰，陰盛則脾寒愈甚，腹中有寒，故入夜腹中作痛而啼。
若孕母脾氣急躁，或平素恣食香燥炙烤之物，或過服溫熱藥物，蘊蓄之熱遺於胎兒。出生後將養過溫，受火熱之氣薰灼，心火上炎，積熱上擾，則心神不安而啼哭不止。由於心火過亢，陰不能潛陽，故夜間不寐而啼哭不寧。徹夜啼哭之後，陽氣耗損，無力抗爭，故白天入寐;正氣未復，入夜又啼。周而復始，循環不已。
心主驚而藏神，小兒神氣怯弱，智慧未充，。若見異常之物，或聞特異聲響，而致驚恐。驚則傷神，恐則傷志，致使心神不寧，神志不安，寐中驚惕，因驚而啼。
總之，寒則痛而啼，熱則煩而啼，驚則神不安而啼，是以寒、熱、驚爲本病之主要病因病機。
